Saat ini UNMUL memiliki 14 fakultas dengan lebih dari 100 program studi dari jenjang Diploma, Sarjana, Magister, Doktor, hingga Profesi. Fakultas tersebut adalah:

1. Fakultas Ekonomi dan Bisnis
2. Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik
3. Fakultas Pertanian
4. Fakultas Kehutanan dan Lingkungan Tropis
5. Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
6. Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan
7. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
8. Fakultas Kedokteran
9. Fakultas Teknik
10. Fakultas Hukum
11. Fakultas Kesehatan Masyarakat
12. Fakultas Farmasi
13. Fakultas Ilmu Budaya
14. Fakultas Kedokteran Gigi; dan
15. Pascasarjana

UNMUL menetapkan Rencana Induk Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (RIP-PM) 2025-2029, dengan fokus utama:

1. Biodiversitas Tropis dan Konservasi
2. Energi Terbarukan dan Ketahanan Energi
3. Kesehatan, Obat Tropis, dan Bioteknologi
4. Ketahanan Pangan dan Pertanian Berkelanjutan
5. Smart City dan Inovasi Digital
6. Sosial Humaniora dan Kebijakan Publik

Hasil penelitian UNMUL telah menghasilkan ribuan publikasi nasional dan internasional, Hak Kekayaan Intelektual (HKI), serta teknologi inovatif yang diaplikasikan melalui pengabdian masyarakat.

UNMUL aktif dalam pemberdayaan masyarakat, mendukung pembangunan daerah, serta memberikan solusi berbasis riset untuk sektor lingkungan, energi, kesehatan, pendidikan, dan sosial-ekonomi di Kalimantan Timur.

UNMUL menjalin kerja sama strategis dengan:

1. Perguruan Tinggi (UI, ITB, UGM, Universitas di ASEAN, Jepang, Australia, Eropa)
2. Lembaga Penelitian (BRIN, LIPI, CIFOR, WWF)
3. Pemerintah Daerah dan Nasional
4. Industri dan Dunia Usaha
5. Organisasi Internasional (DAAD, USAID, Erasmus+, AUN-QA)

Sebagai universitas terbesar di Kalimantan Timur, UNMUL berkontribusi dalam:

1. Peningkatan SDM: mencetak lulusan berkompeten yang terserap di dunia kerja nasional maupun internasional.
2. Ilmu Pengetahuan dan Teknologi: menghasilkan penelitian dan inovasi relevan dengan kebutuhan bangsa.
3. Pembangunan Daerah: mendukung hilirisasi riset, penguatan kebijakan publik, serta pembangunan berkelanjutan.
4. Konservasi Lingkungan: fokus pada lahan basah tropis, kehutanan, dan biodiversitas khas Kalimantan.

Universitas Mulawarman (UNMUL) merupakan perguruan tinggi negeri terbesar di Kalimantan Timur dengan visi menjadi universitas berkelas dunia. UNMUL berperan sebagai pusat pengembangan ilmu pengetahuan, riset, dan inovasi yang mendukung pembangunan daerah dan nasional, serta memiliki komitmen kuat terhadap keberlanjutan lingkungan lahan basah tropis.